スーパーでアンコウの切り身をかったところ　生きた寄生虫が３匹入っていました。こういった食品寄生虫入りのものをスーパーは販売してもいいのでしょうか?食品衛生法的の異物混入に引っかからないのでしょうか?

販売してもいいかどうかといえば、販売するべきではないでしょう。ただし、法違反となる可能性は低いと思います。喫食し、健康被害があっても「家庭」を原因とする事件となると思います。
なお、寄生虫は「目に見えるもの」だけではないことに御留意ください。